日韩a天堂2018在线手机_却送人间到白头。_日产
您当前的位置:  主页 > 新闻中心 >
  • 2019
    07-09
  • 2019
    07-09
    例如,我们描述了卵巢癌样本中原始RNA-seq数据的分析,以定义排序gene list7。对reads进行质控和过滤(例如去除低质量碱基)并比对到全基因组范围的参考转录本,以对每个转录本比对到的reads进行计数。reads计数在基因水平上汇总(对每个基因计数)。通常,可获得多个实验条件(两个或更多个,例如治疗和对照)中的每一个的多个生物学重复(三个或更多个)的RNA-seq数据。不同样品对应的每个基因的reads计数进行标准化,以去除样品之间不必要的技术性差异(例如,由于测序lane或每测序获得的总reads数的差异)26,27,28。接下来,检验每个基因的reads数是否在样品分组之间存在差异表达(例如,处理与对照)(RNA-seq和芯片数据分别对应补充流程1和2)。R包如edgeR 29,DESeq 30,LIMMA / VOOM 31,32和Cufflinks 33等,用于RNA-seq数据标准化和差异表达分析。差异基因表达分析结果包括:(i)描述差异表达显著性的 P值; (ii)相关 Q值(又称校正后的 P.值,是对所有基因的多重检验进行校正(例如,通过使用BH-FDR程序34(box3)); (iii)表达变化的效应大小和方向,上调的基因是阳性的,在列表的顶部;下调的基因是阴性的,在列表的底部,通常表示为log-transformed fold-change。然后依据一个或多个值对gene list进行排序(例如-log10 P值乘以log-transformed fold-change),进行通路富集分析研究。
  • 2019
    07-09
    我知道超多织女都不喜欢我发图解,求人不如求己嘛~这么多好看又实用的图解,可千万不要因为不会看图解错过了吖!你们还是先学习看图解吧!
  • 2019
    07-09
    这些数据库由管理团队维护,他们手动收集详细的通路信息,包括生化反应,基因调控事件和其他基因相互作用。信息可以导出或转换为基因集格式。
电话
www.chinaboxes.cn